为落实中俄两国总理定期会晤成果、国家及省市“十三·五”发展规划纲要，以及中科院与安徽省在科技成果转化领域合作精神。基于国家创新驱动发展战略、系统推进全面创新改革试验的核心任务总体要求，中科院合肥物质科学研究院与合肥市政府合作共建“合肥离子医学中心”以“合作+自主”创新模式，依托“east 超导托克马克实验装置”等国家大科学工程技术基础，与国际一流科研院所、跨国企业、医疗机构战略合作，引进成熟、先进的质子治疗系统，研制超导质子治疗系统等国际水准的高端医疗装备，整合创新资源、开展多学科交叉研究、催生变革性技术，推动高端医疗装备产业布局，建设集离子医学技术研发、治疗、培训、数据化处理中心和离子医学医疗装备的研发、国产化，两个公共平台为一体的创新科技基地，助力安徽省及合肥市战略性新兴产业发展。
2016 年 3 月，中国科学院下文[科发函字[2016]56 号]批复同意合肥研究院依托合肥离子医学中心引进和自主研发超导质子治疗系统。作为战略性新兴产业和大健康产业，同时也是合肥综合性国家科学中心七大平台首个落地的项目，合肥离子医学中心的公共平台—合肥中科离子医学技术装备有限公司，致力于研发、制造 sc200 超导质子治疗系统，同时积极开展与国内外先进的研发机构、高端医疗装备制造企业、国际一流离子治疗机构合作，力争快速、高质量的实现产业化，推动合肥市大健康产业和高端医疗装备技术加速发展。