学院设有“综合办公室/学生工作办公室”“人才培养办公室”“医院管理办公室”“科研与学科建设办公室”4个正处级行政管理机构，组成单位包括：基础医学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、附属第一医院(第一临床学院)、附属第二医院(第二临床学院)、附属南华医院(南华临床学院)、附属长沙中心医院(长沙中心医院临床学院)、附属第三医院(第三临床学院)、附属公共卫生医院、附属第七医院等15家附属医院（其中4所直属三甲综合性医院），拥有一级学科博士后科研流动站1个（基础医学），一级学科博士学位授权点2个（基础医学、临床医学），一级学科硕士学位授权点6个（基础医学、临床医学、生物学、药学、公共卫生与预防医学、护理学），硕士专业学位授权类别4种（临床医学、药学、公共卫生硕士、护理学），医学类本科专业11个，形成了完整的医学人才培养体系，并在本科、硕士和博士层次招收来华留学生，具有推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士学位研究生资格和硕-博连读招生资格。现有全日制本科生7509人，博士、硕士研究生5466人，国际学生372人(含博士、硕士46人）。